什么是NGS？为什么要做NGS检测？
NGS（next-generation sequencing）又称高通量测序技术或下一代测序技术，其能够同时对上百万甚至数十亿个DNA片段进行测序，可一次对多个至上百个肿瘤相关基因（驱动基因、伴随突变基因）、全外显子以及全基因组进行检测，已在肿瘤基因检测、无创产前筛查、遗传性疾病诊断等多个领域得到应用，国内外多项指南和共识均认可基于二代测序全面分子检测对于指导临床治疗的价值。全面而准确的肿瘤基因诊断结果可明确肿瘤患者病变组织的基因变异信息，从而进行分子特征描述，实现“同病异治”和“异病同治”的精准治疗模式。
随着肿瘤发病人数逐年增加及靶向药物不断上市，NGS检测在肿瘤分型、指导临床用药以及患者用药疗效监测和预后方面已经得到了广泛应用和认可。研究表明，肺腺癌驱动基因变异主要发生在热点区域，高通量测序技术可较全面地检测出肺腺癌驱动基因中具有显著临床意义和潜在临床意义的突变位点，需要检测多个驱动基因时，推荐使用高通量测序技术。
NGS检测可以预测与化疗和靶向治疗相关的总生存期（OS）和无进展生存期（PFS）。
做NGS检测有什么要求？
由临床肿瘤学会肿瘤标志物专家委员会和中国肿瘤驱动基因分析联盟制定的《二代测序技术在肿瘤精准医学诊断中的应用专家共识》中提出，在进行NGS检测项目之前临床医师应依据患者的疾病情况经多学科讨论和患者充分的知情同意后在关键时间节点收集标本进行NGS检测，为患者争取最大的获益，检测结果是否用于辅助个体化治疗须由临床医师决定。
合格的样本是确保NGS检测结果可靠的前提。可用于实体肿瘤体细胞基因突变检测的样本类型优先选用新鲜组织标本，也可以选用石蜡包埋（FFPE）样本、血浆、胸腹水等。肿瘤细胞的含量会影响突变丰度，并最终影响阳性突变阈值的判定，肿瘤细胞含量过低会造成漏检和假阴性。因此，除血浆样本来源外，其他样本应正确估计肿瘤细胞含量，一般情况下，建议NGS检测的组织样本中肿瘤细胞含量达到20%以上，血液样本采集量至少8ml。
NGS检测流程复杂，对实验室环境条件、人员能力及质量管理要求较高。技术流程主要包括三个环节：测序文库构建（核酸提取、文库制备及质量分析）、上机测序和数据分析，每一步都至关重要，最后通过生物信息分析流程将基因变异识别、注释、过滤后，可报告
变异进入临床解读知识库进行变异、癌种、证据匹配，形成可读的结构化 NGS 临床报告，最终对其进行解读及实施临床决策。
(作者：病理科杨勇娅)
